Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSC5DA1L4H1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSC5DA1L4H1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms