Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE3A1L190 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE3A1L190 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms