Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23IPQ9Y6Y8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23IPQ9Y6Y8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23IPQ9Y6Y8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC23IPQ9Y6Y8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC23IPQ9Y6Y8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC23IPQ9Y6Y8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC23IPQ9Y6Y8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms