Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USH1CQ9Y6N9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USH1CQ9Y6N9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USH1CQ9Y6N9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USH1CQ9Y6N9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USH1CQ9Y6N9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USH1CQ9Y6N9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USH1CQ9Y6N9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USH1CQ9Y6N9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USH1CQ9Y6N9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USH1CQ9Y6N9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USH1CQ9Y6N9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms