Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM9Q9Y5J7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM9Q9Y5J7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM9Q9Y5J7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM9Q9Y5J7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM9Q9Y5J7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM9Q9Y5J7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM9Q9Y5J7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM9Q9Y5J7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM9Q9Y5J7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM9Q9Y5J7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM9Q9Y5J7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms