Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRELID3BQ9Y3B1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRELID3BQ9Y3B1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRELID3BQ9Y3B1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRELID3BQ9Y3B1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms