Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM33Q9UPN9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM33Q9UPN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM33Q9UPN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM33Q9UPN9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM33Q9UPN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM33Q9UPN9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM33Q9UPN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM33Q9UPN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM33Q9UPN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms