Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHPKQ9UHJ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHPKQ9UHJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPKQ9UHJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPKQ9UHJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPKQ9UHJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHPKQ9UHJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPKQ9UHJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPKQ9UHJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPKQ9UHJ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPKQ9UHJ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPKQ9UHJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPKQ9UHJ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms