Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL3Q9NYJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL3Q9NYJ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms