Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COA4Q9NYJ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COA4Q9NYJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COA4Q9NYJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COA4Q9NYJ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COA4Q9NYJ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COA4Q9NYJ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms