Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED9Q9NWA0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED9Q9NWA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED9Q9NWA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED9Q9NWA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED9Q9NWA0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED9Q9NWA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms