Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH2

ISYNA1, Inositol-3-phosphate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISYNA1Q9NPH2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ISYNA1Q9NPH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISYNA1Q9NPH2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ISYNA1Q9NPH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ISYNA1Q9NPH2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ISYNA1Q9NPH2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISYNA1Q9NPH2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISYNA1Q9NPH2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ISYNA1Q9NPH2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms