Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREM1Q9NP99 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREM1Q9NP99 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREM1Q9NP99 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREM1Q9NP99 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREM1Q9NP99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREM1Q9NP99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREM1Q9NP99 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms