Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRMS1Q9HCU9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRMS1Q9HCU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRMS1Q9HCU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRMS1Q9HCU9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BRMS1Q9HCU9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRMS1Q9HCU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRMS1Q9HCU9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BRMS1Q9HCU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRMS1Q9HCU9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
BRMS1Q9HCU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRMS1Q9HCU9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRMS1Q9HCU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms