Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM165Q9HC07 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM165Q9HC07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM165Q9HC07 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM165Q9HC07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM165Q9HC07 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM165Q9HC07 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms