Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCPEP1Q9HB40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCPEP1Q9HB40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCPEP1Q9HB40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCPEP1Q9HB40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCPEP1Q9HB40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCPEP1Q9HB40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCPEP1Q9HB40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCPEP1Q9HB40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCPEP1Q9HB40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms