Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A5

CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10Q9H9A5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT10Q9H9A5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT10Q9H9A5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNOT10Q9H9A5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT10Q9H9A5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT10Q9H9A5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT10Q9H9A5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT10Q9H9A5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms