Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VCX3BQ9H321 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCX3BQ9H321 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCX3BQ9H321 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCX3BQ9H321 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCX3BQ9H321 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCX3BQ9H321 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCX3BQ9H321 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCX3BQ9H321 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCX3BQ9H321 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCX3BQ9H321 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms