Protein–RNA interactions for Protein: Q9H161

ALX4, Homeobox protein aristaless-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX4Q9H161 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX4Q9H161 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX4Q9H161 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALX4Q9H161 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX4Q9H161 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALX4Q9H161 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX4Q9H161 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALX4Q9H161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms