Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CADM1Q9BY67 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CADM1Q9BY67 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CADM1Q9BY67 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CADM1Q9BY67 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CADM1Q9BY67 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CADM1Q9BY67 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CADM1Q9BY67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CADM1Q9BY67 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CADM1Q9BY67 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CADM1Q9BY67 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CADM1Q9BY67 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CADM1Q9BY67 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CADM1Q9BY67 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms