Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBB2BQ9BVA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB2BQ9BVA1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB2BQ9BVA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB2BQ9BVA1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB2BQ9BVA1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB2BQ9BVA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBB2BQ9BVA1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBB2BQ9BVA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB2BQ9BVA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB2BQ9BVA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB2BQ9BVA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB2BQ9BVA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms