Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC32Q9BV29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC32Q9BV29 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC32Q9BV29 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC32Q9BV29 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC32Q9BV29 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC32Q9BV29 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms