Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIKE1Q9BRV8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIKE1Q9BRV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIKE1Q9BRV8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIKE1Q9BRV8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIKE1Q9BRV8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIKE1Q9BRV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIKE1Q9BRV8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIKE1Q9BRV8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIKE1Q9BRV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms