Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH3GL2Q99962 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3GL2Q99962 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH3GL2Q99962 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3GL2Q99962 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3GL2Q99962 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3GL2Q99962 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3GL2Q99962 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3GL2Q99962 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3GL2Q99962 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SH3GL2Q99962 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH3GL2Q99962 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3GL2Q99962 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms