Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22AQ96IW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22AQ96IW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22AQ96IW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22AQ96IW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC22AQ96IW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22AQ96IW7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms