Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF185Q96GF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RNF185Q96GF1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF185Q96GF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF185Q96GF1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF185Q96GF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF185Q96GF1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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