Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM12Q96EX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM12Q96EX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM12Q96EX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM12Q96EX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM12Q96EX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM12Q96EX1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms