Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NMD3Q96D46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NMD3Q96D46 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NMD3Q96D46 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NMD3Q96D46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NMD3Q96D46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NMD3Q96D46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms