Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM63Q969Q1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM63Q969Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM63Q969Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM63Q969Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM63Q969Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM63Q969Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM63Q969Q1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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