Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL3LQ92901 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3LQ92901 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL3LQ92901 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3LQ92901 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL3LQ92901 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL3LQ92901 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL3LQ92901 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms