Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC2Q92769 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC2Q92769 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC2Q92769 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC2Q92769 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC2Q92769 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC2Q92769 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC2Q92769 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms