Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCDQ92629 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCDQ92629 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCDQ92629 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCDQ92629 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCDQ92629 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCDQ92629 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGCDQ92629 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCDQ92629 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCDQ92629 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCDQ92629 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGCDQ92629 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms