Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVI7

PPP1R1C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1CQ8WVI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R1CQ8WVI7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R1CQ8WVI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R1CQ8WVI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R1CQ8WVI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R1CQ8WVI7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R1CQ8WVI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R1CQ8WVI7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1CQ8WVI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms