Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MGARPQ8TDB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MGARPQ8TDB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MGARPQ8TDB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MGARPQ8TDB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGARPQ8TDB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MGARPQ8TDB4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MGARPQ8TDB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MGARPQ8TDB4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MGARPQ8TDB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms