Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MDM1Q8TC05 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MDM1Q8TC05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MDM1Q8TC05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM1Q8TC05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MDM1Q8TC05 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM1Q8TC05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MDM1Q8TC05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MDM1Q8TC05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms