Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNIH3Q8TBE1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNIH3Q8TBE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNIH3Q8TBE1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNIH3Q8TBE1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNIH3Q8TBE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH3Q8TBE1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH3Q8TBE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNIH3Q8TBE1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms