Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO27Q8NI29 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO27Q8NI29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO27Q8NI29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO27Q8NI29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO27Q8NI29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO27Q8NI29 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FBXO27Q8NI29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO27Q8NI29 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO27Q8NI29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms