Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFWD2Q8NHY2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RFWD2Q8NHY2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFWD2Q8NHY2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFWD2Q8NHY2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFWD2Q8NHY2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFWD2Q8NHY2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFWD2Q8NHY2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RFWD2Q8NHY2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFWD2Q8NHY2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFWD2Q8NHY2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFWD2Q8NHY2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFWD2Q8NHY2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFWD2Q8NHY2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms