Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13CQ8NE31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM13CQ8NE31 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM13CQ8NE31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13CQ8NE31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13CQ8NE31 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13CQ8NE31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM13CQ8NE31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13CQ8NE31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM13CQ8NE31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM13CQ8NE31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM13CQ8NE31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM13CQ8NE31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms