Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF148Q8N7C7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF148Q8N7C7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF148Q8N7C7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF148Q8N7C7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF148Q8N7C7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF148Q8N7C7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF148Q8N7C7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF148Q8N7C7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF148Q8N7C7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF148Q8N7C7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF148Q8N7C7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF148Q8N7C7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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