Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHC2Q8IXK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC2Q8IXK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC2Q8IXK0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHC2Q8IXK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHC2Q8IXK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHC2Q8IXK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHC2Q8IXK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHC2Q8IXK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms