Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJ21

SPSB3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB3Q6PJ21 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPSB3Q6PJ21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB3Q6PJ21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB3Q6PJ21 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPSB3Q6PJ21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPSB3Q6PJ21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB3Q6PJ21 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPSB3Q6PJ21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB3Q6PJ21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB3Q6PJ21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB3Q6PJ21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms