Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1A2

LPCAT3, Lysophospholipid acyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3Q6P1A2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3Q6P1A2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT3Q6P1A2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3Q6P1A2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT3Q6P1A2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT3Q6P1A2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT3Q6P1A2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPCAT3Q6P1A2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT3Q6P1A2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms