Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT80Q6KB66 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT80Q6KB66 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT80Q6KB66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT80Q6KB66 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT80Q6KB66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT80Q6KB66 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT80Q6KB66 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT80Q6KB66 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT80Q6KB66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT80Q6KB66 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms