Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWT1Q5T5J6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SWT1Q5T5J6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SWT1Q5T5J6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SWT1Q5T5J6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SWT1Q5T5J6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SWT1Q5T5J6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SWT1Q5T5J6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SWT1Q5T5J6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SWT1Q5T5J6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms