Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYAQ5MJ70 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYAQ5MJ70 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPDYAQ5MJ70 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPDYAQ5MJ70 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPDYAQ5MJ70 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPDYAQ5MJ70 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms