Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
COX19Q49B96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COX19Q49B96 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX19Q49B96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COX19Q49B96 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COX19Q49B96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms