Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SKIDA1Q1XH10 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKIDA1Q1XH10 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKIDA1Q1XH10 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SKIDA1Q1XH10 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SKIDA1Q1XH10 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKIDA1Q1XH10 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIDA1Q1XH10 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKIDA1Q1XH10 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms