Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNCBQ16143 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNCBQ16143 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNCBQ16143 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNCBQ16143 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNCBQ16143 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNCBQ16143 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
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