Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC9□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 80.2
PABPC4Q13310 CNPY2-204ENST00000546937 984 ntTSL 28.23□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 80.2
PABPC4Q13310 CNPY2-203ENST00000546466 673 ntTSL 36.46□□□□□ -1.383e-9■■■■■ 80.2
PABPC4Q13310 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 80.2
PABPC4Q13310 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.721e-18■■■■■ 79.7
PABPC4Q13310 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 419.42■□□□□ 0.72e-22■■■■■ 79.6
PABPC4Q13310 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.032e-22■■■■■ 79.6
PABPC4Q13310 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-22■■■■■ 79.6
PABPC4Q13310 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-22■■■■■ 79.6
PABPC4Q13310 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 224.27■■□□□ 1.486e-7■■■■■ 79
PABPC4Q13310 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.057e-11■■■■■ 78.9
PABPC4Q13310 RFXANK-207ENST00000536253 374 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 78.9
PABPC4Q13310 RFXANK-213ENST00000544923 288 ntTSL 511.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 78.9
PABPC4Q13310 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-212ENST00000540597 3744 ntTSL 213.69□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 77.9
PABPC4Q13310 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 77.9
PABPC4Q13310 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-12■■■■■ 77.5
PABPC4Q13310 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)20.49■□□□□ 0.874e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.684e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.64e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.554e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.494e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 217.9■□□□□ 0.464e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.1□□□□□ -1.753e-8■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-323■■■■■ 76.9
PABPC4Q13310 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-323■■■■■ 76.9
PABPC4Q13310 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-323■■■■■ 76.9
PABPC4Q13310 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 76.9
PABPC4Q13310 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.491e-323■■■■■ 76.9
PABPC4Q13310 USP16-206ENST00000485067 2259 ntTSL 210.03□□□□□ -0.82e-11■■■■■ 76.6
PABPC4Q13310 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 76.6
PABPC4Q13310 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 76.6
PABPC4Q13310 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-11■■■■■ 76.6
PABPC4Q13310 USP16-205ENST00000474835 3835 ntTSL 1 (best)4.63□□□□□ -1.672e-11■■■■■ 76.6
PABPC4Q13310 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-24■■■■■ 76.4
PABPC4Q13310 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.227e-24■■■■■ 76.4
PABPC4Q13310 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.868e-8■■■■■ 76.3
PABPC4Q13310 TAF6-203ENST00000421980 2685 ntTSL 518.13■□□□□ 0.498e-8■■■■■ 76.3
PABPC4Q13310 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.448e-8■■■■■ 76.3
PABPC4Q13310 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.268e-8■■■■■ 76.3
PABPC4Q13310 TAF6-213ENST00000472509 2551 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 76.3
PABPC4Q13310 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 219.55■□□□□ 0.722e-11■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 219.34■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFA12-206ENST00000547986 487 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.331e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFA12-204ENST00000547157 276 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFA12-202ENST00000538372 472 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFA12-209ENST00000552205 813 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFA12-207ENST00000550187 517 ntTSL 46.37□□□□□ -1.391e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFA12-208ENST00000551991 546 ntTSL 56.32□□□□□ -1.41e-16■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-19■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-19■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.87□□□□□ -1.792e-19■■■■■ 76.2
PABPC4Q13310 NDUFS4-203ENST00000506765 559 ntTSL 214.3□□□□□ -0.129e-18■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.539e-18■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 NDUFS4-204ENST00000506974 833 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.579e-18■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 NDUFS4-205ENST00000507026 680 ntTSL 310.95□□□□□ -0.669e-18■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 CTSB-211ENST00000526481 660 ntTSL 516.77■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.242e-11■■■■■ 75.7
PABPC4Q13310 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.752e-11■■■■■ 75.7
PABPC4Q13310 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.552e-11■■■■■ 75.7
PABPC4Q13310 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.52e-11■■■■■ 75.7
PABPC4Q13310 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 515.82■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 75.6
PABPC4Q13310 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.096e-8■■■■■ 75.5
PABPC4Q13310 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 75.5
PABPC4Q13310 SELENOH-203ENST00000533321 1454 ntTSL 1 (best)19.82■□□□□ 0.766e-8■■■■■ 75.5
PABPC4Q13310 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.259e-10■■■■■ 74.9
PABPC4Q13310 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-24■■■■■ 74.6
PABPC4Q13310 MND1-201ENST00000240488 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-24■■■■■ 74.6
PABPC4Q13310 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 74.5
PABPC4Q13310 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 74.5
PABPC4Q13310 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 74.5
PABPC4Q13310 TIMM44-210ENST00000599939 2227 nt22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 516.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.257e-15■■■■■ 73.8
PABPC4Q13310 C17orf58-203ENST00000536693 1654 ntTSL 1 (best)22.43■■□□□ 1.187e-15■■■■■ 73.8
PABPC4Q13310 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.157e-15■■■■■ 73.8
PABPC4Q13310 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.341e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 LSM6-207ENST00000515311 545 ntTSL 424.45■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 LSM6-204ENST00000504181 549 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.752e-23■■■■■ 72.8
PABPC4Q13310 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.422e-23■■■■■ 72.8
PABPC4Q13310 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -01e-17■■■■■ 72.6
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 77.1 ms