Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC9□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 80.2
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PABPC4Q13310 CNPY2-203ENST00000546466 673 ntTSL 36.46□□□□□ -1.383e-9■■■■■ 80.2
PABPC4Q13310 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 80.2
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PABPC4Q13310 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 78.6
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PABPC4Q13310 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-212ENST00000540597 3744 ntTSL 213.69□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 78.6
PABPC4Q13310 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 77.9
PABPC4Q13310 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 77.9
PABPC4Q13310 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-12■■■■■ 77.5
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PABPC4Q13310 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.684e-12■■■■■ 77.3
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PABPC4Q13310 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.554e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 77.3
PABPC4Q13310 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.494e-12■■■■■ 77.3
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PABPC4Q13310 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.227e-24■■■■■ 76.4
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PABPC4Q13310 TAF6-213ENST00000472509 2551 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 76.3
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PABPC4Q13310 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.87□□□□□ -1.792e-19■■■■■ 76.2
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PABPC4Q13310 NDUFS4-205ENST00000507026 680 ntTSL 310.95□□□□□ -0.669e-18■■■■■ 75.9
PABPC4Q13310 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 75.9
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PABPC4Q13310 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.52e-11■■■■■ 75.7
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PABPC4Q13310 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.096e-8■■■■■ 75.5
PABPC4Q13310 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 75.5
PABPC4Q13310 SELENOH-203ENST00000533321 1454 ntTSL 1 (best)19.82■□□□□ 0.766e-8■■■■■ 75.5
PABPC4Q13310 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.259e-10■■■■■ 74.9
PABPC4Q13310 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-24■■■■■ 74.6
PABPC4Q13310 MND1-201ENST00000240488 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-24■■■■■ 74.6
PABPC4Q13310 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 74.5
PABPC4Q13310 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 74.5
PABPC4Q13310 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 74.5
PABPC4Q13310 TIMM44-210ENST00000599939 2227 nt22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 516.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 74
PABPC4Q13310 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.257e-15■■■■■ 73.8
PABPC4Q13310 C17orf58-203ENST00000536693 1654 ntTSL 1 (best)22.43■■□□□ 1.187e-15■■■■■ 73.8
PABPC4Q13310 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.157e-15■■■■■ 73.8
PABPC4Q13310 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.341e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 LSM6-207ENST00000515311 545 ntTSL 424.45■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 LSM6-204ENST00000504181 549 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 73.4
PABPC4Q13310 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.752e-23■■■■■ 72.8
PABPC4Q13310 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.422e-23■■■■■ 72.8
PABPC4Q13310 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-17■■■■■ 72.6
PABPC4Q13310 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -01e-17■■■■■ 72.6
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